国家基础学科公共科学数据中心成立于2019年，是由中国科学院、教育部、交通运输部、工信部、国防科工局、国家林草局、黑龙江省等下属研究所共40余家单位共同建设的国家科技资源共享服务平台。汇集管理物理、化学、材料、动物、植物、交通、信息科学等基础学科领域，青海湖、黑龙江、新疆等典型区域长期科研活动积累的科学数据，以及相关领域政府预算资金支持项目汇交的科学数据。目前，数据资源覆盖17类一级学科，数据总量2.29PB，在线公开4714个数据集，包括23个主题库，累计服务国家重点研发计划项目数据汇交1200余个，有效支撑国家项目绩效评估工作。已形成完善的基础学科数据资源体系，以及分布式科学数据资源统一管理、集成融合、分析挖掘和应用服务的技术体系、标准体系和服务体系，牵头或参与制定科学数据相关国家标准19项。有力支持了数据驱动的基础 学科原始创新、多学科交叉融合创新、国民经济发展、人民生命健康和国际交流。2021年入选国家“十三五”科技成就展、中国科学院“十三五”信息化成果展；2022年度入选中国科学院科学数据工作十大进展。
国家基础学科公共科学数据中心积极参与开放科学活动。2021年助力开放科学国际创新联盟成立，向全球科学界发出“北京倡议”，传递出推动全球科学界加强协同合作的声音。建设权威数据库并对外开放，联合国际园艺学会建立权威的世界山茶属植物品种数据库，汇集全球山茶品种数据，已成为本领域世界最全的、高标准的权威参考型数据库；载人航天空间科学与应用数据库是目前唯一面向公众开放的载人航天空间科学与应用数据权威发布网站，为海洋测绘、工程勘察设计等提供重要数据支持；中国活体脑成像共享数据库数据长期支撑了国际大型开放科学活动（如BrainHack），提高了中国在脑科学领域的国际话语权，而且催生了一系列脑科学国际前沿发现，促进了“发展群体神经科学”新学科诞生，形成了广泛国际影响力。